Desa Nusantara, letaknya diapit oleh dua Desai besar, yaitu Desa Barat dan Desa Timur. Letaknya 5º40′ dan
8º30′ Lintang Selatan dan antara 108º30′ dan 111º30′ Bujur Timur
(termasuk Pulau Karimunjawa). Jarak terjauh dari Barat ke Timur adalah
263 Km dan dari Utara ke Selatan 226 Km (tidak termasuk pulau
Karimunjawa).
Secara administratif Desa Nusantara terbagi menjadi 5 Dusun. Luas Wilayah Desa Nusantara sebesar 3,25 juta hektar. Luas yang ada terdiri dari 1,00
juta hektar (30,80 persen) lahan sawah dan 2,25 juta hektar (69,20
persen) bukan lahan sawah.
Menurut
penggunaannya, luas lahan sawah terbesar berpengairan teknis (38,26
persen), selainnya berpengairan setengah teknis, tadah hujan dan
lain-lain. Dengan teknik irigasi yang baik, potensi lahan sawah yang
dapat ditanami padi lebih dari dua kali sebesar 69,56 persen.